16 mm-film finns i två basmaterial: cellulosaacetat (använt 1923–1990-talet) och polyester (från 1990-talet och framåt). Acetatbaserad 16 mm drabbas av ättiksyndromet (vinegar syndrome) — samma kemiska nedbrytning som påverkar 8 mm och Super 8. Acetatbasen frisätter ättiksyra när den bryts ner, filmen krymper och böjer sig, och till slut kan den inte längre passera genom någon projektor eller scanner. De flesta 16 mm-rullar från 1920- till 1980-talen är acetatbaserade och i riskzonen.
Färgfilmen som användes för 16 mm var generellt stabilare än hemma-8 mm — mycket av den 16 mm-film vi tar emot är inspelad på Kodachrome eller Ektachrome, som bleknar långsammare än de billigare färgsorterna. Men efter 50–80 år förlorar även den bästa färgfilmen viss mättnad och förskjuts mot magenta eller gult.
16 mm har ett unikt problem som 8 mm saknar: ljud. Många 16 mm-rullar har ljud inspelat direkt på filmen, antingen som ett optiskt spår (variable-area eller variable-density) längs bilden, eller som en magnetremsa. Magnetremsor på 16 mm är sköra och benägna att flaga, och de kräver specialutrustning för uppspelning. De flesta digitaliseringstjänster hoppar över ljudet helt eller gör ett dåligt jobb.
Det fjärde problemet, gemensamt för alla filmformat, är uppspelningsutrustning. 16 mm-projektorer tillverkades senast i början av 1990-talet och reservdelar är sällsynta. Professionella filmscanners som arkiv använder kostar över 500 000 kr — de flesta digitaliseringstjänster har inte sådana.
